Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM68Q6AZZ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM68Q6AZZ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM68Q6AZZ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM68Q6AZZ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM68Q6AZZ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms