Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kpna1Q60960 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kpna1Q60960 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kpna1Q60960 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kpna1Q60960 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Kpna1Q60960 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Kpna1Q60960 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kpna1Q60960 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kpna1Q60960 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kpna1Q60960 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kpna1Q60960 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kpna1Q60960 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kpna1Q60960 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kpna1Q60960 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Kpna1Q60960 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kpna1Q60960 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kpna1Q60960 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kpna1Q60960 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kpna1Q60960 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kpna1Q60960 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kpna1Q60960 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kpna1Q60960 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kpna1Q60960 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kpna1Q60960 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kpna1Q60960 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kpna1Q60960 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kpna1Q60960 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms