Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Kpna1Q60960 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Kpna1Q60960 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Kpna1Q60960 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Kpna1Q60960 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Kpna1Q60960 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Kpna1Q60960 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Kpna1Q60960 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kpna1Q60960 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Kpna1Q60960 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Kpna1Q60960 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Kpna1Q60960 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Kpna1Q60960 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kpna1Q60960 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Kpna1Q60960 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kpna1Q60960 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kpna1Q60960 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kpna1Q60960 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kpna1Q60960 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kpna1Q60960 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kpna1Q60960 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kpna1Q60960 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kpna1Q60960 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Kpna1Q60960 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kpna1Q60960 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Kpna1Q60960 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kpna1Q60960 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kpna1Q60960 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kpna1Q60960 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Kpna1Q60960 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kpna1Q60960 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kpna1Q60960 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kpna1Q60960 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kpna1Q60960 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kpna1Q60960 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kpna1Q60960 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Kpna1Q60960 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Kpna1Q60960 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kpna1Q60960 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kpna1Q60960 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kpna1Q60960 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Kpna1Q60960 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Kpna1Q60960 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Kpna1Q60960 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Kpna1Q60960 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Kpna1Q60960 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Kpna1Q60960 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Kpna1Q60960 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Kpna1Q60960 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Kpna1Q60960 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Kpna1Q60960 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Kpna1Q60960 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Kpna1Q60960 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Kpna1Q60960 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Kpna1Q60960 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Kpna1Q60960 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Kpna1Q60960 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Kpna1Q60960 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Kpna1Q60960 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Kpna1Q60960 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kpna1Q60960 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kpna1Q60960 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kpna1Q60960 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kpna1Q60960 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Kpna1Q60960 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kpna1Q60960 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kpna1Q60960 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Kpna1Q60960 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Kpna1Q60960 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kpna1Q60960 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kpna1Q60960 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kpna1Q60960 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kpna1Q60960 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kpna1Q60960 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kpna1Q60960 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kpna1Q60960 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kpna1Q60960 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kpna1Q60960 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Kpna1Q60960 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Kpna1Q60960 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Kpna1Q60960 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kpna1Q60960 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Kpna1Q60960 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kpna1Q60960 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kpna1Q60960 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kpna1Q60960 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kpna1Q60960 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kpna1Q60960 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Kpna1Q60960 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kpna1Q60960 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kpna1Q60960 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kpna1Q60960 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kpna1Q60960 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Kpna1Q60960 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kpna1Q60960 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kpna1Q60960 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kpna1Q60960 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Kpna1Q60960 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kpna1Q60960 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kpna1Q60960 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms