Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DQA1Q5Y7H0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQA1Q5Y7H0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQA1Q5Y7H0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQA1Q5Y7H0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms