Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM236Q5W0B7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM236Q5W0B7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM236Q5W0B7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM236Q5W0B7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM236Q5W0B7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM236Q5W0B7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms