Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZK1Q5T2W1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZK1Q5T2W1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDZK1Q5T2W1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDZK1Q5T2W1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZK1Q5T2W1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms