Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAPCD1Q5SSQ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAPCD1Q5SSQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAPCD1Q5SSQ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAPCD1Q5SSQ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SAPCD1Q5SSQ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms