Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOHLH1Q5JUK2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOHLH1Q5JUK2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOHLH1Q5JUK2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SOHLH1Q5JUK2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOHLH1Q5JUK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms