Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRRT3Q5FWE3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRRT3Q5FWE3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRRT3Q5FWE3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRRT3Q5FWE3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRT3Q5FWE3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRRT3Q5FWE3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRRT3Q5FWE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRRT3Q5FWE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRRT3Q5FWE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRT3Q5FWE3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms