Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COX19Q49B96 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COX19Q49B96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX19Q49B96 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COX19Q49B96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX19Q49B96 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COX19Q49B96 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COX19Q49B96 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COX19Q49B96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms