Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX4Q33E94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX4Q33E94 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX4Q33E94 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX4Q33E94 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFX4Q33E94 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX4Q33E94 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX4Q33E94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms