Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF2Q1L5Z9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LONRF2Q1L5Z9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LONRF2Q1L5Z9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF2Q1L5Z9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LONRF2Q1L5Z9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LONRF2Q1L5Z9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms