Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP6V1FQ16864 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6V1FQ16864 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V1FQ16864 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6V1FQ16864 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6V1FQ16864 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6V1FQ16864 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms