Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
GRIK5Q16478 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GRIK5Q16478 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIK5Q16478 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIK5Q16478 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIK5Q16478 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIK5Q16478 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIK5Q16478 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIK5Q16478 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GRIK5Q16478 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
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