Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATXN8Q156A1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATXN8Q156A1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATXN8Q156A1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATXN8Q156A1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATXN8Q156A1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATXN8Q156A1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms