Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAM1Q15629 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAM1Q15629 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAM1Q15629 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAM1Q15629 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAM1Q15629 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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