Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NCAPD2Q15021 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NCAPD2Q15021 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NCAPD2Q15021 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NCAPD2Q15021 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NCAPD2Q15021 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NCAPD2Q15021 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NCAPD2Q15021 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NCAPD2Q15021 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NCAPD2Q15021 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NCAPD2Q15021 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NCAPD2Q15021 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCAPD2Q15021 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCAPD2Q15021 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
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