Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
SHROOM2Q13796 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SHROOM2Q13796 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SHROOM2Q13796 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
SHROOM2Q13796 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
SHROOM2Q13796 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SHROOM2Q13796 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
SHROOM2Q13796 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
SHROOM2Q13796 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SHROOM2Q13796 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SHROOM2Q13796 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
SHROOM2Q13796 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
SHROOM2Q13796 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
SHROOM2Q13796 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
SHROOM2Q13796 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
SHROOM2Q13796 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SHROOM2Q13796 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SHROOM2Q13796 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
SHROOM2Q13796 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SHROOM2Q13796 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SHROOM2Q13796 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SHROOM2Q13796 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SHROOM2Q13796 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SHROOM2Q13796 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
SHROOM2Q13796 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
SHROOM2Q13796 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
SHROOM2Q13796 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SHROOM2Q13796 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
SHROOM2Q13796 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
SHROOM2Q13796 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SHROOM2Q13796 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SHROOM2Q13796 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
SHROOM2Q13796 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM2Q13796 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
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