Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOFQ13790 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOFQ13790 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOFQ13790 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOFQ13790 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOFQ13790 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOFQ13790 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOFQ13790 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOFQ13790 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOFQ13790 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOFQ13790 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOFQ13790 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOFQ13790 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOFQ13790 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOFQ13790 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOFQ13790 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOFQ13790 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOFQ13790 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APOFQ13790 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOFQ13790 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOFQ13790 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOFQ13790 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOFQ13790 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOFQ13790 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOFQ13790 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOFQ13790 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOFQ13790 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOFQ13790 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOFQ13790 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOFQ13790 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOFQ13790 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOFQ13790 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOFQ13790 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOFQ13790 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOFQ13790 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOFQ13790 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOFQ13790 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOFQ13790 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOFQ13790 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOFQ13790 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOFQ13790 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOFQ13790 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOFQ13790 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOFQ13790 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOFQ13790 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOFQ13790 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOFQ13790 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOFQ13790 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOFQ13790 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOFQ13790 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOFQ13790 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOFQ13790 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOFQ13790 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOFQ13790 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOFQ13790 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOFQ13790 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOFQ13790 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOFQ13790 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOFQ13790 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOFQ13790 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOFQ13790 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOFQ13790 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOFQ13790 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOFQ13790 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOFQ13790 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOFQ13790 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOFQ13790 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOFQ13790 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOFQ13790 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOFQ13790 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOFQ13790 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOFQ13790 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOFQ13790 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOFQ13790 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOFQ13790 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOFQ13790 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOFQ13790 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOFQ13790 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOFQ13790 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOFQ13790 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOFQ13790 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOFQ13790 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOFQ13790 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOFQ13790 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOFQ13790 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOFQ13790 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOFQ13790 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOFQ13790 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOFQ13790 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOFQ13790 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOFQ13790 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOFQ13790 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOFQ13790 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOFQ13790 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOFQ13790 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOFQ13790 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOFQ13790 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOFQ13790 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOFQ13790 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOFQ13790 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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