Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C1orf61Q13536 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf61Q13536 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1orf61Q13536 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf61Q13536 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1orf61Q13536 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf61Q13536 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms