Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PICALMQ13492 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PICALMQ13492 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PICALMQ13492 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PICALMQ13492 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PICALMQ13492 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PICALMQ13492 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PICALMQ13492 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PICALMQ13492 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PICALMQ13492 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PICALMQ13492 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PICALMQ13492 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PICALMQ13492 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PICALMQ13492 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PICALMQ13492 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PICALMQ13492 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PICALMQ13492 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PICALMQ13492 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PICALMQ13492 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
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