Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPM6BQ13491 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPM6BQ13491 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPM6BQ13491 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPM6BQ13491 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPM6BQ13491 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPM6BQ13491 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPM6BQ13491 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPM6BQ13491 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms