Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIGQ13278 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIGQ13278 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIGQ13278 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIGQ13278 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIGQ13278 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIGQ13278 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIGQ13278 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIGQ13278 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIGQ13278 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIGQ13278 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIGQ13278 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIGQ13278 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIGQ13278 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIGQ13278 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIGQ13278 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIGQ13278 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIGQ13278 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIGQ13278 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIGQ13278 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIGQ13278 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIGQ13278 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIGQ13278 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIGQ13278 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIGQ13278 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIGQ13278 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIGQ13278 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIGQ13278 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIGQ13278 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIGQ13278 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIGQ13278 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIGQ13278 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIGQ13278 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIGQ13278 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIGQ13278 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIGQ13278 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIGQ13278 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIGQ13278 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIGQ13278 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIGQ13278 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIGQ13278 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIGQ13278 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIGQ13278 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIGQ13278 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIGQ13278 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIGQ13278 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIGQ13278 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIGQ13278 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIGQ13278 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIGQ13278 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIGQ13278 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RIGQ13278 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIGQ13278 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIGQ13278 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RIGQ13278 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIGQ13278 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIGQ13278 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RIGQ13278 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RIGQ13278 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIGQ13278 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIGQ13278 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIGQ13278 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIGQ13278 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIGQ13278 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIGQ13278 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIGQ13278 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIGQ13278 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIGQ13278 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIGQ13278 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIGQ13278 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIGQ13278 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIGQ13278 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIGQ13278 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIGQ13278 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIGQ13278 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIGQ13278 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIGQ13278 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIGQ13278 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIGQ13278 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIGQ13278 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIGQ13278 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIGQ13278 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIGQ13278 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIGQ13278 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIGQ13278 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIGQ13278 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIGQ13278 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIGQ13278 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIGQ13278 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RIGQ13278 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIGQ13278 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIGQ13278 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIGQ13278 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIGQ13278 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIGQ13278 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIGQ13278 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIGQ13278 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIGQ13278 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIGQ13278 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIGQ13278 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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