Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CBX3Q13185 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX3Q13185 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX3Q13185 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX3Q13185 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX3Q13185 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX3Q13185 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX3Q13185 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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