Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT88Q13099 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT88Q13099 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT88Q13099 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT88Q13099 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT88Q13099 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT88Q13099 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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