Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPB3Q12988 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPB3Q12988 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSPB3Q12988 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HSPB3Q12988 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPB3Q12988 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPB3Q12988 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPB3Q12988 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms