Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXF2Q12947 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXF2Q12947 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXF2Q12947 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXF2Q12947 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXF2Q12947 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXF2Q12947 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXF2Q12947 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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