Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NFIAQ12857 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NFIAQ12857 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NFIAQ12857 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NFIAQ12857 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NFIAQ12857 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NFIAQ12857 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NFIAQ12857 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NFIAQ12857 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NFIAQ12857 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NFIAQ12857 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NFIAQ12857 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NFIAQ12857 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NFIAQ12857 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NFIAQ12857 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NFIAQ12857 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
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