Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX4Q12846 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX4Q12846 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX4Q12846 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX4Q12846 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX4Q12846 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX4Q12846 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX4Q12846 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX4Q12846 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX4Q12846 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX4Q12846 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX4Q12846 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX4Q12846 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX4Q12846 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX4Q12846 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX4Q12846 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX4Q12846 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX4Q12846 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX4Q12846 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX4Q12846 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX4Q12846 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX4Q12846 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX4Q12846 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX4Q12846 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX4Q12846 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX4Q12846 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX4Q12846 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX4Q12846 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX4Q12846 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX4Q12846 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX4Q12846 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STX4Q12846 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STX4Q12846 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX4Q12846 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX4Q12846 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX4Q12846 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX4Q12846 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX4Q12846 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX4Q12846 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX4Q12846 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX4Q12846 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX4Q12846 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STX4Q12846 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX4Q12846 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX4Q12846 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX4Q12846 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX4Q12846 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX4Q12846 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX4Q12846 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX4Q12846 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX4Q12846 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX4Q12846 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX4Q12846 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX4Q12846 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX4Q12846 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX4Q12846 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX4Q12846 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX4Q12846 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STX4Q12846 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX4Q12846 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX4Q12846 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX4Q12846 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX4Q12846 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX4Q12846 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX4Q12846 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX4Q12846 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX4Q12846 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX4Q12846 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX4Q12846 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX4Q12846 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX4Q12846 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX4Q12846 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX4Q12846 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX4Q12846 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX4Q12846 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX4Q12846 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX4Q12846 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX4Q12846 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX4Q12846 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX4Q12846 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX4Q12846 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STX4Q12846 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX4Q12846 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX4Q12846 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX4Q12846 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX4Q12846 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STX4Q12846 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX4Q12846 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STX4Q12846 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STX4Q12846 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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