Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 MEP3YPR138C 1470 nt9.51□□□□□ -0.89
LPX1Q12405 CSM1YCR086W 573 nt9.5□□□□□ -0.89
LPX1Q12405 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.5□□□□□ -0.89
LPX1Q12405 TOA2YKL058W 369 nt9.49□□□□□ -0.89
LPX1Q12405 CCT5YJR064W 1689 nt9.43□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 SSN3YPL042C 1668 nt9.42□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 GND2YGR256W 1479 nt9.42□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 SHY1YGR112W 1170 nt9.42□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 LSB5YCL034W 1065 nt9.42□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 BIO5YNR056C 1686 nt9.42□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 UFO1YML088W 2007 nt9.41□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.4□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 YJL118WYJL118W 660 nt9.4□□□□□ -0.9
LPX1Q12405 BNI5YNL166C 1347 nt9.39□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 GAL3YDR009W 1563 nt9.39□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 SAM3YPL274W 1764 nt9.38□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 PHO23YNL097C 993 nt9.38□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 PGC1YPL206C 966 nt9.38□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 RPT5YOR117W 1305 nt9.37□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 NAR1YNL240C 1476 nt9.37□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 MSC1YML128C 1542 nt9.36□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 PAU5YFL020C 369 nt9.36□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 NUC1YJL208C 990 nt9.36□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 PAM17YKR065C 594 nt9.36□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 SEN2YLR105C 1134 nt9.36□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 URA6YKL024C 615 nt9.35□□□□□ -0.91
LPX1Q12405 REG2YBR050C 1017 nt9.33□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 RIB7YBR153W 735 nt9.33□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 YBR232CYBR232C 360 nt9.33□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 SEC61YLR378C 1443 nt9.32□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 OXA1YER154W 1209 nt9.32□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 OYE3YPL171C 1203 nt9.32□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 THI72YOR192C 1800 nt9.31□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 STP3YLR375W 1032 nt9.31□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 ZRT3YKL175W 1512 nt9.31□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 SAM2YDR502C 1155 nt9.3□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 NAP1YKR048C 1254 nt9.3□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 TAF13YML098W 504 nt9.29□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 SNZ1YMR096W 894 nt9.29□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 PUP1YOR157C 786 nt9.29□□□□□ -0.92
LPX1Q12405 FUB1YCR076C 753 nt9.27□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 PET8YNL003C 855 nt9.27□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 TPS1YBR126C 1488 nt9.27□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 RAS2YNL098C 969 nt9.26□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 MET8YBR213W 825 nt9.26□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 YER188WYER188W 720 nt9.25□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 OYE2YHR179W 1203 nt9.24□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 YJL064WYJL064W 396 nt9.23□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 YMR262WYMR262W 942 nt9.23□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 DLD2YDL178W 1593 nt9.22□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 EAF3YPR023C 1206 nt9.22□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 YPR126CYPR126C 309 nt9.22□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 FLR1YBR008C 1647 nt9.22□□□□□ -0.93
LPX1Q12405 YJL067WYJL067W 351 nt9.2□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 MHF1YOL086W-A 273 nt9.2□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 DAK2YFL053W 1776 nt9.19□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 CTI6YPL181W 1521 nt9.19□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 PBP1YGR178C 2169 nt9.19□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 POT1YIL160C 1254 nt9.18□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 PAU19YMR325W 375 nt9.17□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 CMP2YML057W 1815 nt9.17□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 YPS3YLR121C 1527 nt9.16□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 FMS1YMR020W 1527 nt9.16□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 RSC8YFR037C 1674 nt9.16□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 GSF2YML048W 1212 nt9.15□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 IML3YBR107C 738 nt9.15□□□□□ -0.94
LPX1Q12405 OSH7YHR001W 1314 nt9.14□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 TMA23YMR269W 636 nt9.14□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 PAR32YDL173W 888 nt9.12□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 YNL024CYNL024C 741 nt9.12□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 TUB4YLR212C 1422 nt9.12□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 HSL7YBR133C 2484 nt9.11□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 HEM13YDR044W 987 nt9.11□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 DDI1YER143W 1287 nt9.11□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 APS2YJR058C 444 nt9.11□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 SOL2YCR073W-A 948 nt9.1□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 SPP2YOR148C 558 nt9.1□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 NIF3YGL221C 867 nt9.09□□□□□ -0.95
LPX1Q12405 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.08□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 LSM5YER146W 282 nt9.08□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 IMO32YGR031W 1029 nt9.08□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 CYT2YKL087C 675 nt9.08□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 SLG1YOR008C 1137 nt9.08□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 ARA2YMR041C 1008 nt9.07□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 CWC15YDR163W 528 nt9.06□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 ACH1YBL015W 1581 nt9.06□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 TAT2YOL020W 1779 nt9.06□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 BUR6YER159C 429 nt9.05□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 YDR455CYDR455C 309 nt9.04□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 TIM44YIL022W 1296 nt9.04□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.03□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 SPS100YHR139C 981 nt9.03□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 TIP1YBR067C 633 nt9.03□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 Q0010Q0010 387 nt9.03□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.03□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.03□□□□□ -0.96
LPX1Q12405 HEL2YDR266C 1920 nt9.01□□□□□ -0.97
LPX1Q12405 RRT8YOL048C 1029 nt8.99□□□□□ -0.97
LPX1Q12405 VPS62YGR141W 1404 nt8.98□□□□□ -0.97
LPX1Q12405 IGD1YFR017C 588 nt8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.9 ms