Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 PET8YNL003C 855 nt9.41□□□□□ -0.9
LDB17Q12342 OXA1YER154W 1209 nt9.4□□□□□ -0.9
LDB17Q12342 RIM8YGL045W 1629 nt9.39□□□□□ -0.91
LDB17Q12342 CSM1YCR086W 573 nt9.38□□□□□ -0.91
LDB17Q12342 PHO23YNL097C 993 nt9.38□□□□□ -0.91
LDB17Q12342 YPI1YFR003C 468 nt9.37□□□□□ -0.91
LDB17Q12342 SEC61YLR378C 1443 nt9.36□□□□□ -0.91
LDB17Q12342 HXT12YIL170W 1374 nt9.36□□□□□ -0.91
LDB17Q12342 MSC1YML128C 1542 nt9.35□□□□□ -0.91
LDB17Q12342 BNI5YNL166C 1347 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 YGL114WYGL114W 2178 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 HOL1YNR055C 1761 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 YNR029CYNR029C 1290 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 MUP1YGR055W 1725 nt9.33□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 ILV3YJR016C 1758 nt9.32□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 SAM2YDR502C 1155 nt9.32□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 ADH1YOL086C 1047 nt9.32□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 FLR1YBR008C 1647 nt9.31□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 BSP1YPR171W 1731 nt9.31□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 FMS1YMR020W 1527 nt9.31□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 DLD2YDL178W 1593 nt9.29□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 YPS3YLR121C 1527 nt9.29□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 CWC15YDR163W 528 nt9.28□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 YOR325WYOR325W 474 nt9.28□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 ACH1YBL015W 1581 nt9.28□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 SAM3YPL274W 1764 nt9.27□□□□□ -0.92
LDB17Q12342 RSC8YFR037C 1674 nt9.27□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 FUB1YCR076C 753 nt9.27□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 YER188WYER188W 720 nt9.27□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.27□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 VRG4YGL225W 1014 nt9.26□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 LSB5YCL034W 1065 nt9.26□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 RIB2YOL066C 1776 nt9.25□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 YNL024CYNL024C 741 nt9.25□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 SPP2YOR148C 558 nt9.25□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 YJL055WYJL055W 738 nt9.24□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 NUC1YJL208C 990 nt9.24□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 YJL118WYJL118W 660 nt9.23□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 RPT5YOR117W 1305 nt9.23□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 HEM13YDR044W 987 nt9.22□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 OPI10YOL032W 741 nt9.22□□□□□ -0.93
LDB17Q12342 YJL195CYJL195C 702 nt9.2□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 GAL3YDR009W 1563 nt9.19□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 FUN14YAL008W 597 nt9.18□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 MAE1YKL029C 2010 nt9.18□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 RAS2YNL098C 969 nt9.17□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 CCT2YIL142W 1584 nt9.16□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 VPS62YGR141W 1404 nt9.16□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 OSH7YHR001W 1314 nt9.16□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 EAF3YPR023C 1206 nt9.16□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 COQ8YGL119W 1506 nt9.15□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 OYE2YHR179W 1203 nt9.15□□□□□ -0.94
LDB17Q12342 RIB7YBR153W 735 nt9.14□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 YDL086WYDL086W 822 nt9.13□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 ARO8YGL202W 1503 nt9.13□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 TPS1YBR126C 1488 nt9.13□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 LSB6YJL100W 1824 nt9.12□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 TAT2YOL020W 1779 nt9.1□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 SOL2YCR073W-A 948 nt9.1□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 YEL008WYEL008W 381 nt9.1□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 UGP1YKL035W 1500 nt9.1□□□□□ -0.95
LDB17Q12342 KES1YPL145C 1305 nt9.07□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 CCT5YJR064W 1689 nt9.07□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 GPN2YOR262W 1044 nt9.07□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 SGA1YIL099W 1650 nt9.07□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 GID7YCL039W 2238 nt9.07□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 HIS2YFR025C 1008 nt9.06□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 TMA23YMR269W 636 nt9.06□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 YDR455CYDR455C 309 nt9.05□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 YLR349WYLR349W 507 nt9.05□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 STE4YOR212W 1272 nt9.05□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 MET2YNL277W 1461 nt9.04□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 BET2YPR176C 978 nt9.04□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 ACO2YJL200C 2370 nt9.04□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 SNZ1YMR096W 894 nt9.03□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 ZAP1YJL056C 2643 nt9.03□□□□□ -0.96
LDB17Q12342 DAK2YFL053W 1776 nt9.02□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.02□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.02□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.02□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.02□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 YMR209CYMR209C 1374 nt9.01□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 DDI1YER143W 1287 nt9.01□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 YPR126CYPR126C 309 nt9.01□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 IMO32YGR031W 1029 nt9□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 SFP1YLR403W 2052 nt9□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 RAD51YER095W 1203 nt8.99□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 LSM5YER146W 282 nt8.99□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 RRT8YOL048C 1029 nt8.99□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 DIG1YPL049C 1359 nt8.99□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 AIM1YAL046C 357 nt8.97□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 QDR2YIL121W 1629 nt8.97□□□□□ -0.97
LDB17Q12342 ENT4YLL038C 744 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 NPP1YCR026C 2229 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 ERG13YML126C 1476 nt8.96□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 ESBP6YNL125C 2022 nt8.93□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 THI72YOR192C 1800 nt8.93□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 CPD1YGR247W 720 nt8.92□□□□□ -0.98
LDB17Q12342 SAC7YDR389W 1965 nt8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms