Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 UFO1YML088W 2007 nt8.07□□□□□ -1.12
USB1Q12208 YMR103CYMR103C 363 nt8.07□□□□□ -1.12
USB1Q12208 SPT20YOL148C 1815 nt8.07□□□□□ -1.12
USB1Q12208 FCY21YER060W 1587 nt8.06□□□□□ -1.12
USB1Q12208 CWC15YDR163W 528 nt8.04□□□□□ -1.12
USB1Q12208 RPC82YPR190C 1965 nt8.04□□□□□ -1.12
USB1Q12208 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.03□□□□□ -1.12
USB1Q12208 UGA4YDL210W 1716 nt8.03□□□□□ -1.12
USB1Q12208 SEC61YLR378C 1443 nt8.02□□□□□ -1.13
USB1Q12208 GTB1YDR221W 2109 nt8.02□□□□□ -1.13
USB1Q12208 HMG2YLR450W 3138 nt8□□□□□ -1.13
USB1Q12208 OXA1YER154W 1209 nt8□□□□□ -1.13
USB1Q12208 LOT5YKL183W 921 nt7.99□□□□□ -1.13
USB1Q12208 SMM1YNR015W 1155 nt7.99□□□□□ -1.13
USB1Q12208 PRY1YJL079C 900 nt7.97□□□□□ -1.13
USB1Q12208 NUC1YJL208C 990 nt7.97□□□□□ -1.13
USB1Q12208 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.96□□□□□ -1.14
USB1Q12208 HEM14YER014W 1620 nt7.96□□□□□ -1.14
USB1Q12208 CAB5YDR196C 726 nt7.95□□□□□ -1.14
USB1Q12208 PHO23YNL097C 993 nt7.95□□□□□ -1.14
USB1Q12208 LSB5YCL034W 1065 nt7.95□□□□□ -1.14
USB1Q12208 YPI1YFR003C 468 nt7.94□□□□□ -1.14
USB1Q12208 RSC8YFR037C 1674 nt7.94□□□□□ -1.14
USB1Q12208 VPS62YGR141W 1404 nt7.94□□□□□ -1.14
USB1Q12208 TPO4YOR273C 1980 nt7.93□□□□□ -1.14
USB1Q12208 SPP2YOR148C 558 nt7.93□□□□□ -1.14
USB1Q12208 BNI5YNL166C 1347 nt7.93□□□□□ -1.14
USB1Q12208 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.93□□□□□ -1.14
USB1Q12208 MSC1YML128C 1542 nt7.93□□□□□ -1.14
USB1Q12208 ILV3YJR016C 1758 nt7.92□□□□□ -1.14
USB1Q12208 YER188WYER188W 720 nt7.92□□□□□ -1.14
USB1Q12208 DLD2YDL178W 1593 nt7.9□□□□□ -1.14
USB1Q12208 YPS3YLR121C 1527 nt7.9□□□□□ -1.14
USB1Q12208 FMS1YMR020W 1527 nt7.9□□□□□ -1.14
USB1Q12208 CSM1YCR086W 573 nt7.9□□□□□ -1.14
USB1Q12208 TOK1YJL093C 2076 nt7.9□□□□□ -1.15
USB1Q12208 VRG4YGL225W 1014 nt7.89□□□□□ -1.15
USB1Q12208 YDL086WYDL086W 822 nt7.88□□□□□ -1.15
USB1Q12208 RAS2YNL098C 969 nt7.88□□□□□ -1.15
USB1Q12208 FLR1YBR008C 1647 nt7.88□□□□□ -1.15
USB1Q12208 MUP1YGR055W 1725 nt7.87□□□□□ -1.15
USB1Q12208 GAL2YLR081W 1725 nt7.87□□□□□ -1.15
USB1Q12208 OSH7YHR001W 1314 nt7.87□□□□□ -1.15
USB1Q12208 RPT5YOR117W 1305 nt7.87□□□□□ -1.15
USB1Q12208 YNL024CYNL024C 741 nt7.87□□□□□ -1.15
USB1Q12208 OPI10YOL032W 741 nt7.87□□□□□ -1.15
USB1Q12208 HXT12YIL170W 1374 nt7.86□□□□□ -1.15
USB1Q12208 FUB1YCR076C 753 nt7.86□□□□□ -1.15
USB1Q12208 URA8YJR103W 1737 nt7.86□□□□□ -1.15
USB1Q12208 CCT2YIL142W 1584 nt7.85□□□□□ -1.15
USB1Q12208 YOR325WYOR325W 474 nt7.84□□□□□ -1.15
USB1Q12208 RIB7YBR153W 735 nt7.84□□□□□ -1.15
USB1Q12208 ACH1YBL015W 1581 nt7.83□□□□□ -1.16
USB1Q12208 YJL118WYJL118W 660 nt7.82□□□□□ -1.16
USB1Q12208 OYE2YHR179W 1203 nt7.81□□□□□ -1.16
USB1Q12208 YJL055WYJL055W 738 nt7.81□□□□□ -1.16
USB1Q12208 ADH1YOL086C 1047 nt7.81□□□□□ -1.16
USB1Q12208 RIB2YOL066C 1776 nt7.8□□□□□ -1.16
USB1Q12208 YNR029CYNR029C 1290 nt7.8□□□□□ -1.16
USB1Q12208 FUN14YAL008W 597 nt7.79□□□□□ -1.16
USB1Q12208 HEM13YDR044W 987 nt7.78□□□□□ -1.16
USB1Q12208 YJL195CYJL195C 702 nt7.78□□□□□ -1.16
USB1Q12208 SOL2YCR073W-A 948 nt7.76□□□□□ -1.17
USB1Q12208 GPN2YOR262W 1044 nt7.76□□□□□ -1.17
USB1Q12208 EAF3YPR023C 1206 nt7.76□□□□□ -1.17
USB1Q12208 HOL1YNR055C 1761 nt7.76□□□□□ -1.17
USB1Q12208 SAM3YPL274W 1764 nt7.76□□□□□ -1.17
USB1Q12208 DIG1YPL049C 1359 nt7.75□□□□□ -1.17
USB1Q12208 MAE1YKL029C 2010 nt7.75□□□□□ -1.17
USB1Q12208 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.75□□□□□ -1.17
USB1Q12208 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.75□□□□□ -1.17
USB1Q12208 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.75□□□□□ -1.17
USB1Q12208 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.75□□□□□ -1.17
USB1Q12208 TPS1YBR126C 1488 nt7.75□□□□□ -1.17
USB1Q12208 COQ8YGL119W 1506 nt7.73□□□□□ -1.17
USB1Q12208 ARO8YGL202W 1503 nt7.73□□□□□ -1.17
USB1Q12208 STE4YOR212W 1272 nt7.73□□□□□ -1.17
USB1Q12208 RSC4YKR008W 1878 nt7.72□□□□□ -1.17
USB1Q12208 GAL3YDR009W 1563 nt7.72□□□□□ -1.17
USB1Q12208 QDR2YIL121W 1629 nt7.72□□□□□ -1.17
USB1Q12208 HIS2YFR025C 1008 nt7.72□□□□□ -1.17
USB1Q12208 ENT4YLL038C 744 nt7.72□□□□□ -1.17
USB1Q12208 BET2YPR176C 978 nt7.72□□□□□ -1.17
USB1Q12208 MCM5YLR274W 2328 nt7.72□□□□□ -1.17
USB1Q12208 LSM5YER146W 282 nt7.71□□□□□ -1.18
USB1Q12208 KES1YPL145C 1305 nt7.71□□□□□ -1.18
USB1Q12208 YEL008WYEL008W 381 nt7.7□□□□□ -1.18
USB1Q12208 YLR349WYLR349W 507 nt7.7□□□□□ -1.18
USB1Q12208 LSB6YJL100W 1824 nt7.7□□□□□ -1.18
USB1Q12208 AIM1YAL046C 357 nt7.69□□□□□ -1.18
USB1Q12208 TAT2YOL020W 1779 nt7.67□□□□□ -1.18
USB1Q12208 YLR046CYLR046C 813 nt7.67□□□□□ -1.18
USB1Q12208 THI72YOR192C 1800 nt7.66□□□□□ -1.18
USB1Q12208 YGL114WYGL114W 2178 nt7.66□□□□□ -1.18
USB1Q12208 TMA23YMR269W 636 nt7.66□□□□□ -1.18
USB1Q12208 RIM8YGL045W 1629 nt7.66□□□□□ -1.18
USB1Q12208 SGA1YIL099W 1650 nt7.66□□□□□ -1.18
USB1Q12208 FRA1YLL029W 2250 nt7.66□□□□□ -1.18
USB1Q12208 DDI1YER143W 1287 nt7.65□□□□□ -1.18
USB1Q12208 CCT5YJR064W 1689 nt7.64□□□□□ -1.19
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