Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 SMM1YNR015W 1155 nt8.94□□□□□ -0.98
NMD4Q12129 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.9□□□□□ -0.98
NMD4Q12129 SSN3YPL042C 1668 nt8.89□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 PRY1YJL079C 900 nt8.89□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 CWC15YDR163W 528 nt8.88□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 SEC61YLR378C 1443 nt8.88□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 YPI1YFR003C 468 nt8.86□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 RIM8YGL045W 1629 nt8.86□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 YGL114WYGL114W 2178 nt8.85□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.85□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 BNI5YNL166C 1347 nt8.84□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 OXA1YER154W 1209 nt8.84□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 NUC1YJL208C 990 nt8.84□□□□□ -0.99
NMD4Q12129 CSM1YCR086W 573 nt8.82□□□□□ -1
NMD4Q12129 PHO23YNL097C 993 nt8.82□□□□□ -1
NMD4Q12129 LSB5YCL034W 1065 nt8.82□□□□□ -1
NMD4Q12129 VRG4YGL225W 1014 nt8.81□□□□□ -1
NMD4Q12129 RSC8YFR037C 1674 nt8.81□□□□□ -1
NMD4Q12129 MSC1YML128C 1542 nt8.8□□□□□ -1
NMD4Q12129 SPP2YOR148C 558 nt8.8□□□□□ -1
NMD4Q12129 NME1NME1 340 nt8.8□□□□□ -1
NMD4Q12129 DLD2YDL178W 1593 nt8.79□□□□□ -1
NMD4Q12129 YER188WYER188W 720 nt8.79□□□□□ -1
NMD4Q12129 FMS1YMR020W 1527 nt8.79□□□□□ -1
NMD4Q12129 FLR1YBR008C 1647 nt8.78□□□□□ -1
NMD4Q12129 YPS3YLR121C 1527 nt8.77□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.77□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 ADH1YOL086C 1047 nt8.77□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 MUP1YGR055W 1725 nt8.77□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 RIB2YOL066C 1776 nt8.76□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 HXT12YIL170W 1374 nt8.76□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 YJL055WYJL055W 738 nt8.76□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 RAS2YNL098C 969 nt8.76□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 FUB1YCR076C 753 nt8.75□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 YNR029CYNR029C 1290 nt8.75□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 RPT5YOR117W 1305 nt8.75□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 VPS62YGR141W 1404 nt8.74□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 MAE1YKL029C 2010 nt8.74□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 OSH7YHR001W 1314 nt8.72□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 ILV3YJR016C 1758 nt8.71□□□□□ -1.01
NMD4Q12129 YJL118WYJL118W 660 nt8.71□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 MAS1YLR163C 1389 nt8.71□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 ACH1YBL015W 1581 nt8.7□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 YJL195CYJL195C 702 nt8.7□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 YOR325WYOR325W 474 nt8.7□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 HOL1YNR055C 1761 nt8.7□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 YDL086WYDL086W 822 nt8.69□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 YNL024CYNL024C 741 nt8.69□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 RIB7YBR153W 735 nt8.69□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 Q0010Q0010 387 nt8.69□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 SAM3YPL274W 1764 nt8.68□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 OYE2YHR179W 1203 nt8.68□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 CCT2YIL142W 1584 nt8.68□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 MCM5YLR274W 2328 nt8.66□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 HEM13YDR044W 987 nt8.66□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 TPS1YBR126C 1488 nt8.65□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 OPI10YOL032W 741 nt8.65□□□□□ -1.02
NMD4Q12129 SOL2YCR073W-A 948 nt8.64□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 FUN14YAL008W 597 nt8.64□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 EAF3YPR023C 1206 nt8.64□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 GAL3YDR009W 1563 nt8.63□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 LSM5YER146W 282 nt8.61□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 SFP1YLR403W 2052 nt8.6□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 MET2YNL277W 1461 nt8.6□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 GPN2YOR262W 1044 nt8.6□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 ACO2YJL200C 2370 nt8.59□□□□□ -1.03
NMD4Q12129 YEL008WYEL008W 381 nt8.58□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.58□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 TAT2YOL020W 1779 nt8.58□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 YJR154WYJR154W 1041 nt8.57□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 GID7YCL039W 2238 nt8.57□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 BET2YPR176C 978 nt8.56□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 ARO8YGL202W 1503 nt8.55□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 DDI1YER143W 1287 nt8.55□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 STE4YOR212W 1272 nt8.55□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 DIG1YPL049C 1359 nt8.54□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 AIM1YAL046C 357 nt8.54□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 TMA23YMR269W 636 nt8.54□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 LSB6YJL100W 1824 nt8.54□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 QDR2YIL121W 1629 nt8.54□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 CCT5YJR064W 1689 nt8.53□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 COQ8YGL119W 1506 nt8.53□□□□□ -1.04
NMD4Q12129 YDR455CYDR455C 309 nt8.51□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 KES1YPL145C 1305 nt8.51□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 ENT4YLL038C 744 nt8.5□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 NPP1YCR026C 2229 nt8.5□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 IMO32YGR031W 1029 nt8.49□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 DAK2YFL053W 1776 nt8.48□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 YLR046CYLR046C 813 nt8.48□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 ERG13YML126C 1476 nt8.48□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 THI72YOR192C 1800 nt8.47□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 HMG2YLR450W 3138 nt8.47□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 RSC4YKR008W 1878 nt8.47□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 SNZ1YMR096W 894 nt8.47□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 YMR209CYMR209C 1374 nt8.47□□□□□ -1.05
NMD4Q12129 HIS2YFR025C 1008 nt8.46□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 YLR349WYLR349W 507 nt8.46□□□□□ -1.06
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