Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBXN1Q04323 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBXN1Q04323 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN1Q04323 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN1Q04323 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN1Q04323 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN1Q04323 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBXN1Q04323 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBXN1Q04323 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBXN1Q04323 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UBXN1Q04323 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN1Q04323 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBXN1Q04323 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN1Q04323 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms