Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 TIM44YIL022W 1296 nt10.98□□□□□ -0.65
UBX2Q04228 SNF1YDR477W 1902 nt10.97□□□□□ -0.65
UBX2Q04228 NUC1YJL208C 990 nt10.97□□□□□ -0.65
UBX2Q04228 HSL7YBR133C 2484 nt10.96□□□□□ -0.65
UBX2Q04228 TOA2YKL058W 369 nt10.96□□□□□ -0.65
UBX2Q04228 YPL251WYPL251W 303 nt10.96□□□□□ -0.65
UBX2Q04228 YMR103CYMR103C 363 nt10.95□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 BRR1YPR057W 1026 nt10.95□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 RIB7YBR153W 735 nt10.95□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 HXT1YHR094C 1713 nt10.95□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 CSM1YCR086W 573 nt10.94□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 BIO5YNR056C 1686 nt10.94□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 PBP1YGR178C 2169 nt10.92□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 YJL118WYJL118W 660 nt10.92□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 CMP2YML057W 1815 nt10.91□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 RPT5YOR117W 1305 nt10.9□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 SLG1YOR008C 1137 nt10.9□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 YBL086CYBL086C 1401 nt10.9□□□□□ -0.66
UBX2Q04228 IRC24YIR036C 792 nt10.89□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 SSN3YPL042C 1668 nt10.89□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 PAR32YDL173W 888 nt10.88□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 GAL3YDR009W 1563 nt10.88□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 DBP1YPL119C 1854 nt10.88□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 LEU9YOR108W 1815 nt10.87□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 CYT2YKL087C 675 nt10.87□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 YMR262WYMR262W 942 nt10.87□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 SAM2YDR502C 1155 nt10.84□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 HIF1YLL022C 1158 nt10.84□□□□□ -0.67
UBX2Q04228 GND2YGR256W 1479 nt10.82□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 YJR114WYJR114W 393 nt10.82□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 TIP1YBR067C 633 nt10.82□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.81□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 GSF2YML048W 1212 nt10.81□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 RIB1YBL033C 1038 nt10.81□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 BNI5YNL166C 1347 nt10.81□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 POT1YIL160C 1254 nt10.8□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 PHO23YNL097C 993 nt10.8□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 MHF1YOL086W-A 273 nt10.79□□□□□ -0.68
UBX2Q04228 SNZ1YMR096W 894 nt10.77□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 TUB4YLR212C 1422 nt10.76□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 SEC61YLR378C 1443 nt10.75□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 MSC1YML128C 1542 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 SOD2YHR008C 702 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 RAS2YNL098C 969 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 SAM3YPL274W 1764 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 OYE2YHR179W 1203 nt10.72□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 YPR126CYPR126C 309 nt10.72□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 TPS1YBR126C 1488 nt10.72□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.72□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.72□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 YIA6YIL006W 1122 nt10.71□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 IML3YBR107C 738 nt10.71□□□□□ -0.69
UBX2Q04228 CTI6YPL181W 1521 nt10.7□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 SHY1YGR112W 1170 nt10.7□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 ERG6YML008C 1152 nt10.7□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 YNL024CYNL024C 741 nt10.7□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 YER188WYER188W 720 nt10.69□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 OXA1YER154W 1209 nt10.68□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 HEL2YDR266C 1920 nt10.67□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 OYE3YPL171C 1203 nt10.67□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 APS2YJR058C 444 nt10.66□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 UFO1YML088W 2007 nt10.66□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 DAK2YFL053W 1776 nt10.65□□□□□ -0.7
UBX2Q04228 URA6YKL024C 615 nt10.64□□□□□ -0.71
UBX2Q04228 YAT1YAR035W 2064 nt10.64□□□□□ -0.71
UBX2Q04228 PET8YNL003C 855 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX2Q04228 FUB1YCR076C 753 nt10.61□□□□□ -0.71
UBX2Q04228 YCP4YCR004C 744 nt10.6□□□□□ -0.71
UBX2Q04228 EAF3YPR023C 1206 nt10.6□□□□□ -0.71
UBX2Q04228 IGD1YFR017C 588 nt10.57□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 NIF3YGL221C 867 nt10.57□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 KRE1YNL322C 942 nt10.56□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 OSH7YHR001W 1314 nt10.56□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 ACO2YJL200C 2370 nt10.55□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 YCR025CYCR025C 411 nt10.55□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 TMA23YMR269W 636 nt10.55□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 SAM50YNL026W 1455 nt10.55□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 ZRT3YKL175W 1512 nt10.54□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 LSM5YER146W 282 nt10.53□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 DLD2YDL178W 1593 nt10.52□□□□□ -0.72
UBX2Q04228 QDR2YIL121W 1629 nt10.52□□□□□ -0.73
UBX2Q04228 DDI1YER143W 1287 nt10.52□□□□□ -0.73
UBX2Q04228 POP2YNR052C 1302 nt10.51□□□□□ -0.73
UBX2Q04228 SPS100YHR139C 981 nt10.48□□□□□ -0.73
UBX2Q04228 SOL2YCR073W-A 948 nt10.47□□□□□ -0.73
UBX2Q04228 IMO32YGR031W 1029 nt10.47□□□□□ -0.73
UBX2Q04228 IPL1YPL209C 1104 nt10.47□□□□□ -0.73
UBX2Q04228 RSC8YFR037C 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
UBX2Q04228 FLR1YBR008C 1647 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt10.45□□□□□ -0.74
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