Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RELAQ04206 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RELAQ04206 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RELAQ04206 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RELAQ04206 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RELAQ04206 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RELAQ04206 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RELAQ04206 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RELAQ04206 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RELAQ04206 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RELAQ04206 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RELAQ04206 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RELAQ04206 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RELAQ04206 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RELAQ04206 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RELAQ04206 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RELAQ04206 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RELAQ04206 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RELAQ04206 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RELAQ04206 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RELAQ04206 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RELAQ04206 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RELAQ04206 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RELAQ04206 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RELAQ04206 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RELAQ04206 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RELAQ04206 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RELAQ04206 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RELAQ04206 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RELAQ04206 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RELAQ04206 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RELAQ04206 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RELAQ04206 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RELAQ04206 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RELAQ04206 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RELAQ04206 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RELAQ04206 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RELAQ04206 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RELAQ04206 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RELAQ04206 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RELAQ04206 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RELAQ04206 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RELAQ04206 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RELAQ04206 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RELAQ04206 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RELAQ04206 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RELAQ04206 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RELAQ04206 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RELAQ04206 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RELAQ04206 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RELAQ04206 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RELAQ04206 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RELAQ04206 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RELAQ04206 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RELAQ04206 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RELAQ04206 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RELAQ04206 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RELAQ04206 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RELAQ04206 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RELAQ04206 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RELAQ04206 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RELAQ04206 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RELAQ04206 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RELAQ04206 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RELAQ04206 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RELAQ04206 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RELAQ04206 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RELAQ04206 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RELAQ04206 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RELAQ04206 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RELAQ04206 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RELAQ04206 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RELAQ04206 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RELAQ04206 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RELAQ04206 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RELAQ04206 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RELAQ04206 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RELAQ04206 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RELAQ04206 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RELAQ04206 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RELAQ04206 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RELAQ04206 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RELAQ04206 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RELAQ04206 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RELAQ04206 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RELAQ04206 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RELAQ04206 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RELAQ04206 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RELAQ04206 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RELAQ04206 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RELAQ04206 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RELAQ04206 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RELAQ04206 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RELAQ04206 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RELAQ04206 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RELAQ04206 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RELAQ04206 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RELAQ04206 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RELAQ04206 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RELAQ04206 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms