Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SP4Q02446 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SP4Q02446 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SP4Q02446 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SP4Q02446 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SP4Q02446 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SP4Q02446 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SP4Q02446 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SP4Q02446 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SP4Q02446 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SP4Q02446 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SP4Q02446 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SP4Q02446 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SP4Q02446 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SP4Q02446 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SP4Q02446 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SP4Q02446 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SP4Q02446 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SP4Q02446 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SP4Q02446 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SP4Q02446 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SP4Q02446 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SP4Q02446 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SP4Q02446 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SP4Q02446 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SP4Q02446 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SP4Q02446 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SP4Q02446 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SP4Q02446 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SP4Q02446 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SP4Q02446 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SP4Q02446 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SP4Q02446 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SP4Q02446 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SP4Q02446 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SP4Q02446 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SP4Q02446 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SP4Q02446 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP4Q02446 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP4Q02446 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SP4Q02446 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SP4Q02446 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SP4Q02446 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SP4Q02446 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SP4Q02446 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SP4Q02446 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SP4Q02446 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SP4Q02446 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SP4Q02446 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SP4Q02446 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SP4Q02446 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SP4Q02446 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SP4Q02446 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SP4Q02446 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SP4Q02446 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SP4Q02446 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SP4Q02446 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SP4Q02446 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SP4Q02446 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SP4Q02446 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SP4Q02446 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SP4Q02446 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SP4Q02446 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP4Q02446 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP4Q02446 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP4Q02446 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP4Q02446 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP4Q02446 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SP4Q02446 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SP4Q02446 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SP4Q02446 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SP4Q02446 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP4Q02446 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP4Q02446 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP4Q02446 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP4Q02446 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP4Q02446 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP4Q02446 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP4Q02446 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SP4Q02446 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SP4Q02446 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SP4Q02446 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SP4Q02446 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SP4Q02446 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SP4Q02446 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SP4Q02446 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SP4Q02446 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SP4Q02446 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SP4Q02446 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SP4Q02446 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SP4Q02446 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SP4Q02446 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SP4Q02446 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SP4Q02446 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SP4Q02446 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SP4Q02446 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SP4Q02446 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SP4Q02446 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SP4Q02446 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SP4Q02446 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms