Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSG1Q02413 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG1Q02413 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSG1Q02413 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DSG1Q02413 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG1Q02413 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSG1Q02413 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms