Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5Q00535 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5Q00535 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5Q00535 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5Q00535 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5Q00535 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5Q00535 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5Q00535 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK5Q00535 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5Q00535 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK5Q00535 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK5Q00535 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDK5Q00535 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK5Q00535 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK5Q00535 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDK5Q00535 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5Q00535 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms