Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPXP78539 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPXP78539 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPXP78539 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPXP78539 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPXP78539 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPXP78539 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPXP78539 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPXP78539 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRPXP78539 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPXP78539 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPXP78539 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPXP78539 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPXP78539 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPXP78539 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPXP78539 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPXP78539 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPXP78539 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPXP78539 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPXP78539 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPXP78539 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPXP78539 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPXP78539 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPXP78539 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPXP78539 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPXP78539 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPXP78539 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPXP78539 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPXP78539 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPXP78539 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPXP78539 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPXP78539 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPXP78539 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPXP78539 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPXP78539 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPXP78539 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPXP78539 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPXP78539 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPXP78539 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPXP78539 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPXP78539 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPXP78539 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPXP78539 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPXP78539 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPXP78539 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPXP78539 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPXP78539 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPXP78539 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPXP78539 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPXP78539 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPXP78539 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPXP78539 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPXP78539 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRPXP78539 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRPXP78539 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRPXP78539 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPXP78539 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPXP78539 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPXP78539 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPXP78539 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPXP78539 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPXP78539 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPXP78539 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPXP78539 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPXP78539 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPXP78539 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPXP78539 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPXP78539 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPXP78539 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPXP78539 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPXP78539 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPXP78539 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPXP78539 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRPXP78539 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRPXP78539 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPXP78539 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRPXP78539 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPXP78539 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPXP78539 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPXP78539 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPXP78539 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPXP78539 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPXP78539 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPXP78539 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPXP78539 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPXP78539 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPXP78539 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPXP78539 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPXP78539 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPXP78539 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPXP78539 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPXP78539 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPXP78539 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPXP78539 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPXP78539 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPXP78539 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPXP78539 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPXP78539 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPXP78539 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPXP78539 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms