Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTG2P63267 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTG2P63267 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTG2P63267 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTG2P63267 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTG2P63267 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTG2P63267 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTG2P63267 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms