Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERV-K104P63124 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERV-K104P63124 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERV-K104P63124 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERV-K104P63124 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERV-K104P63124 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms