Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL11P62913 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL11P62913 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL11P62913 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL11P62913 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL11P62913 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL11P62913 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL11P62913 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL11P62913 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL11P62913 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL11P62913 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL11P62913 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL11P62913 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL11P62913 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL11P62913 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL11P62913 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL11P62913 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL11P62913 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL11P62913 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL11P62913 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL11P62913 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL11P62913 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL11P62913 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL11P62913 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL11P62913 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL11P62913 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL11P62913 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL11P62913 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL11P62913 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL11P62913 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL11P62913 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL11P62913 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL11P62913 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL11P62913 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL11P62913 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL11P62913 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL11P62913 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL11P62913 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL11P62913 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL11P62913 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL11P62913 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL11P62913 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL11P62913 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL11P62913 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL11P62913 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL11P62913 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL11P62913 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL11P62913 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL11P62913 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL11P62913 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL11P62913 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL11P62913 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL11P62913 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL11P62913 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL11P62913 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL11P62913 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL11P62913 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL11P62913 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL11P62913 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL11P62913 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL11P62913 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL11P62913 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL11P62913 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL11P62913 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL11P62913 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL11P62913 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL11P62913 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL11P62913 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL11P62913 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL11P62913 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL11P62913 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL11P62913 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL11P62913 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL11P62913 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL11P62913 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL11P62913 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL11P62913 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL11P62913 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL11P62913 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL11P62913 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL11P62913 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL11P62913 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL11P62913 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL11P62913 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL11P62913 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL11P62913 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL11P62913 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL11P62913 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL11P62913 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL11P62913 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL11P62913 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL11P62913 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL11P62913 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL11P62913 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL11P62913 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL11P62913 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL11P62913 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL11P62913 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL11P62913 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL11P62913 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms