Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL31P62899 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL31P62899 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL31P62899 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL31P62899 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL31P62899 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL31P62899 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL31P62899 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL31P62899 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL31P62899 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL31P62899 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL31P62899 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL31P62899 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL31P62899 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL31P62899 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL31P62899 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL31P62899 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL31P62899 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL31P62899 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL31P62899 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL31P62899 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL31P62899 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL31P62899 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL31P62899 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL31P62899 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL31P62899 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL31P62899 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL31P62899 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL31P62899 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL31P62899 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL31P62899 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL31P62899 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL31P62899 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL31P62899 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL31P62899 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL31P62899 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL31P62899 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL31P62899 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL31P62899 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL31P62899 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL31P62899 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL31P62899 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL31P62899 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL31P62899 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL31P62899 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL31P62899 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL31P62899 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL31P62899 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPL31P62899 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL31P62899 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL31P62899 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL31P62899 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL31P62899 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL31P62899 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL31P62899 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL31P62899 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL31P62899 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL31P62899 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL31P62899 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL31P62899 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL31P62899 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL31P62899 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL31P62899 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL31P62899 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL31P62899 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL31P62899 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL31P62899 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL31P62899 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL31P62899 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL31P62899 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL31P62899 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL31P62899 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL31P62899 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL31P62899 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL31P62899 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL31P62899 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL31P62899 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL31P62899 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL31P62899 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL31P62899 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL31P62899 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL31P62899 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL31P62899 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL31P62899 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL31P62899 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL31P62899 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL31P62899 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL31P62899 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL31P62899 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL31P62899 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL31P62899 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms