Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTA2P62736 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTA2P62736 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTA2P62736 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTA2P62736 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTA2P62736 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTA2P62736 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTA2P62736 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTA2P62736 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms