Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNAP25P60880 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SNAP25P60880 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNAP25P60880 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SNAP25P60880 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SNAP25P60880 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNAP25P60880 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms