Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EIF4A1P60842 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EIF4A1P60842 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EIF4A1P60842 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EIF4A1P60842 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EIF4A1P60842 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EIF4A1P60842 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EIF4A1P60842 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EIF4A1P60842 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EIF4A1P60842 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EIF4A1P60842 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EIF4A1P60842 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
EIF4A1P60842 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EIF4A1P60842 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EIF4A1P60842 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
EIF4A1P60842 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
EIF4A1P60842 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EIF4A1P60842 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EIF4A1P60842 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms