Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVFC1-1P60608 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1-1P60608 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVFC1-1P60608 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1-1P60608 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVFC1-1P60608 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms