Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB25P57735 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB25P57735 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB25P57735 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB25P57735 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB25P57735 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB25P57735 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB25P57735 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB25P57735 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB25P57735 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB25P57735 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB25P57735 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB25P57735 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB25P57735 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB25P57735 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB25P57735 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB25P57735 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB25P57735 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB25P57735 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB25P57735 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB25P57735 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB25P57735 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB25P57735 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB25P57735 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB25P57735 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB25P57735 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB25P57735 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB25P57735 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB25P57735 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB25P57735 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB25P57735 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB25P57735 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB25P57735 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB25P57735 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB25P57735 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB25P57735 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB25P57735 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB25P57735 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB25P57735 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB25P57735 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB25P57735 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB25P57735 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB25P57735 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB25P57735 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB25P57735 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB25P57735 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB25P57735 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB25P57735 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB25P57735 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB25P57735 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB25P57735 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB25P57735 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB25P57735 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB25P57735 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB25P57735 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB25P57735 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB25P57735 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB25P57735 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB25P57735 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB25P57735 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB25P57735 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB25P57735 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB25P57735 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB25P57735 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB25P57735 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB25P57735 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB25P57735 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB25P57735 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB25P57735 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB25P57735 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB25P57735 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB25P57735 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB25P57735 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB25P57735 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB25P57735 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB25P57735 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB25P57735 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB25P57735 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB25P57735 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB25P57735 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB25P57735 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB25P57735 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB25P57735 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB25P57735 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB25P57735 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB25P57735 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB25P57735 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB25P57735 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB25P57735 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB25P57735 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB25P57735 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB25P57735 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB25P57735 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB25P57735 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB25P57735 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB25P57735 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB25P57735 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB25P57735 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB25P57735 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB25P57735 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms