Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME5P56597 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME5P56597 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME5P56597 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME5P56597 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME5P56597 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME5P56597 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME5P56597 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME5P56597 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME5P56597 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME5P56597 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NME5P56597 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME5P56597 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME5P56597 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME5P56597 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME5P56597 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NME5P56597 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NME5P56597 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NME5P56597 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NME5P56597 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME5P56597 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME5P56597 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME5P56597 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME5P56597 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME5P56597 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NME5P56597 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME5P56597 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME5P56597 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NME5P56597 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME5P56597 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME5P56597 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME5P56597 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME5P56597 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME5P56597 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME5P56597 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME5P56597 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME5P56597 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME5P56597 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME5P56597 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NME5P56597 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME5P56597 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME5P56597 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME5P56597 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME5P56597 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME5P56597 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME5P56597 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME5P56597 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME5P56597 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME5P56597 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME5P56597 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NME5P56597 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NME5P56597 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME5P56597 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME5P56597 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME5P56597 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME5P56597 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME5P56597 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME5P56597 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME5P56597 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME5P56597 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME5P56597 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME5P56597 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME5P56597 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME5P56597 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME5P56597 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME5P56597 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME5P56597 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME5P56597 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME5P56597 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME5P56597 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME5P56597 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME5P56597 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME5P56597 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME5P56597 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME5P56597 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME5P56597 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME5P56597 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME5P56597 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME5P56597 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME5P56597 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME5P56597 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME5P56597 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME5P56597 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME5P56597 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME5P56597 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME5P56597 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME5P56597 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME5P56597 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME5P56597 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME5P56597 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME5P56597 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME5P56597 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME5P56597 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NME5P56597 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME5P56597 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME5P56597 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NME5P56597 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME5P56597 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME5P56597 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME5P56597 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms